Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RABEP1Q15276 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RABEP1Q15276 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RABEP1Q15276 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RABEP1Q15276 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RABEP1Q15276 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
RABEP1Q15276 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
RABEP1Q15276 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
RABEP1Q15276 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABEP1Q15276 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RABEP1Q15276 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
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