Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NR1D2Q14995 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NR1D2Q14995 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NR1D2Q14995 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1D2Q14995 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1D2Q14995 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1D2Q14995 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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