Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR1I3Q14994 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1I3Q14994 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR1I3Q14994 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1I3Q14994 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NR1I3Q14994 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
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