Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NEDD9Q14511 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEDD9Q14511 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEDD9Q14511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEDD9Q14511 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD9Q14511 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD9Q14511 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD9Q14511 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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