Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
PKD2Q13563 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PKD2Q13563 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PKD2Q13563 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PKD2Q13563 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PKD2Q13563 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PKD2Q13563 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PKD2Q13563 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PKD2Q13563 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PKD2Q13563 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
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