Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PICALMQ13492 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PICALMQ13492 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PICALMQ13492 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PICALMQ13492 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PICALMQ13492 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PICALMQ13492 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PICALMQ13492 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
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