Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTK7Q13308 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTK7Q13308 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTK7Q13308 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTK7Q13308 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTK7Q13308 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTK7Q13308 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
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