Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BNIP3Q12983 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BNIP3Q12983 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BNIP3Q12983 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BNIP3Q12983 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BNIP3Q12983 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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