Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MYO1EQ12965 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MYO1EQ12965 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MYO1EQ12965 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MYO1EQ12965 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MYO1EQ12965 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms