Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-7■■■■□ 23.6
GRSF1Q12849 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 23.5
GRSF1Q12849 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 23.5
GRSF1Q12849 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.5
GRSF1Q12849 ERMP1-204ENST00000475005 1219 ntTSL 523.63■■□□□ 1.376e-12■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.916e-12■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 ERMP1-206ENST00000489219 3293 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.366e-12■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 ERMP1-203ENST00000462592 3554 ntTSL 216.33■□□□□ 0.26e-12■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-18■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 SLC19A1-208ENST00000468508 1435 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-18■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 SLC19A1-206ENST00000460174 600 ntTSL 314.19□□□□□ -0.141e-18■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.141e-18■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-18■■■■□ 23.4
GRSF1Q12849 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.346e-8■■■■□ 23.3
GRSF1Q12849 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.26e-8■■■■□ 23.3
GRSF1Q12849 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.116e-8■■■■□ 23.3
GRSF1Q12849 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 420.45■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-209ENST00000596067 498 ntTSL 519.88■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-210ENST00000596686 2499 ntTSL 219.67■□□□□ 0.741e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 217.77■□□□□ 0.441e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-214ENST00000598191 732 ntTSL 317.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 217.55■□□□□ 0.41e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 PIK3R2-202ENST00000426902 3273 ntTSL 217.24■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 516.66■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 PIK3R2-203ENST00000459743 465 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-213ENST00000598180 1626 ntTSL 216.1■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 23.1
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GRSF1Q12849 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)15.12■□□□□ 0.011e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-218ENST00000519838 396 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 PIK3R2-204ENST00000464016 588 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 213.56□□□□□ -0.241e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 23.1
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GRSF1Q12849 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.461e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-6■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.811e-8■■■■□ 23.1
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GRSF1Q12849 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 23.1
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GRSF1Q12849 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.59□□□□□ -1.351e-8■■■■□ 23.1
GRSF1Q12849 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.471e-6■■■■□ 23.1
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GRSF1Q12849 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-7■■■■□ 22.9
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GRSF1Q12849 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 22.9
GRSF1Q12849 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.415e-12■■■■□ 22.9
GRSF1Q12849 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.195e-12■■■■□ 22.9
GRSF1Q12849 H3F3B-212ENST00000592643 795 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.449e-11■■■■□ 22.8
GRSF1Q12849 STT3B-202ENST00000423527 1664 ntTSL 225.92■■□□□ 1.745e-17■■■■□ 22.8
GRSF1Q12849 STT3B-204ENST00000453168 1888 ntTSL 1 (best)25.13■■□□□ 1.615e-17■■■■□ 22.8
GRSF1Q12849 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-17■■■■□ 22.8
GRSF1Q12849 IMPDH2-204ENST00000462980 908 ntTSL 210.15□□□□□ -0.781e-10■■■■□ 22.8
GRSF1Q12849 IMP4-210ENST00000462392 1793 ntTSL 320.21■□□□□ 0.831e-6■■■■□ 22.7
GRSF1Q12849 IMP4-208ENST00000460766 2379 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.781e-6■■■■□ 22.7
GRSF1Q12849 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.324e-6■■■■□ 22.7
GRSF1Q12849 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.684e-7■■■■□ 22.6
GRSF1Q12849 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.255e-7■■■■□ 22.6
GRSF1Q12849 OGFOD3-206ENST00000578586 3796 nt12.97□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 22.6
GRSF1Q12849 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-25■■■■□ 22.6
GRSF1Q12849 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-25■■■■□ 22.6
GRSF1Q12849 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-10■■■■□ 22.5
GRSF1Q12849 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.473e-6■■■■□ 22.5
GRSF1Q12849 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.453e-6■■■■□ 22.5
GRSF1Q12849 TMUB1-207ENST00000492838 550 ntTSL 511.53□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 22.5
GRSF1Q12849 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.584e-8■■■■□ 22.5
GRSF1Q12849 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 313.19□□□□□ -0.34e-8■■■■□ 22.5
GRSF1Q12849 CHID1-216ENST00000529539 602 ntTSL 222.63■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 22.4
GRSF1Q12849 CHID1-220ENST00000532909 619 ntTSL 520.24■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 22.4
GRSF1Q12849 CHID1-223ENST00000534207 1171 ntTSL 518.46■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 22.4
GRSF1Q12849 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 22.4
GRSF1Q12849 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■■■□ 22.4
GRSF1Q12849 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.573e-6■■■■□ 22.4
GRSF1Q12849 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 22.3
GRSF1Q12849 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 22.3
GRSF1Q12849 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-18■■■■□ 22.3
GRSF1Q12849 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.031e-18■■■■□ 22.3
GRSF1Q12849 PTPRF-215ENST00000496447 5887 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.311e-18■■■■□ 22.3
GRSF1Q12849 PTPRF-203ENST00000372407 4600 ntTSL 211.05□□□□□ -0.641e-18■■■■□ 22.3
GRSF1Q12849 TJP1-210ENST00000558447 720 ntTSL 326.87■■□□□ 1.892e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 ARHGEF16-205ENST00000445297 836 ntTSL 323.91■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 22.2
GRSF1Q12849 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.152e-6■■■■□ 22.2
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