Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPPLY1Q0D2K3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIPPLY1Q0D2K3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms