Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NIPAL4Q0D2K0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NIPAL4Q0D2K0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NIPAL4Q0D2K0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NIPAL4Q0D2K0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIPAL4Q0D2K0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIPAL4Q0D2K0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIPAL4Q0D2K0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NIPAL4Q0D2K0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIPAL4Q0D2K0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIPAL4Q0D2K0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIPAL4Q0D2K0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms