Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE4CQ08493 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE4CQ08493 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE4CQ08493 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE4CQ08493 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE4CQ08493 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE4CQ08493 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms