Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAX8Q06710 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAX8Q06710 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAX8Q06710 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAX8Q06710 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX8Q06710 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX8Q06710 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAX8Q06710 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAX8Q06710 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAX8Q06710 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAX8Q06710 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PAX8Q06710 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX8Q06710 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX8Q06710 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms