Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKCDQ05655 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCDQ05655 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCDQ05655 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKCDQ05655 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCDQ05655 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms