Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFITM3Q01628 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFITM3Q01628 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFITM3Q01628 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFITM3Q01628 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFITM3Q01628 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms