Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCN7AQ01118 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCN7AQ01118 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
SCN7AQ01118 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SCN7AQ01118 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SCN7AQ01118 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCN7AQ01118 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCN7AQ01118 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SCN7AQ01118 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms