Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK17Q00537 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK17Q00537 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK17Q00537 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK17Q00537 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK17Q00537 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK17Q00537 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms