Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP4F2P78329 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP4F2P78329 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP4F2P78329 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP4F2P78329 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP4F2P78329 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms