Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GNB1P62873 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GNB1P62873 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GNB1P62873 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GNB1P62873 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GNB1P62873 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GNB1P62873 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GNB1P62873 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GNB1P62873 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GNB1P62873 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GNB1P62873 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GNB1P62873 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GNB1P62873 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GNB1P62873 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GNB1P62873 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GNB1P62873 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GNB1P62873 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GNB1P62873 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GNB1P62873 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GNB1P62873 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GNB1P62873 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GNB1P62873 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GNB1P62873 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GNB1P62873 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GNB1P62873 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GNB1P62873 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GNB1P62873 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB1P62873 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB1P62873 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB1P62873 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB1P62873 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GNB1P62873 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB1P62873 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB1P62873 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB1P62873 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GNB1P62873 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GNB1P62873 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GNB1P62873 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GNB1P62873 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB1P62873 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB1P62873 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB1P62873 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB1P62873 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GNB1P62873 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GNB1P62873 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB1P62873 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB1P62873 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB1P62873 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB1P62873 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GNB1P62873 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB1P62873 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB1P62873 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB1P62873 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GNB1P62873 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GNB1P62873 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB1P62873 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB1P62873 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB1P62873 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB1P62873 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GNB1P62873 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB1P62873 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB1P62873 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB1P62873 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GNB1P62873 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GNB1P62873 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB1P62873 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB1P62873 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB1P62873 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB1P62873 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GNB1P62873 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB1P62873 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB1P62873 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB1P62873 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB1P62873 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB1P62873 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GNB1P62873 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB1P62873 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB1P62873 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB1P62873 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GNB1P62873 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms