Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVFC1-1P60608 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVFC1-1P60608 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVFC1-1P60608 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ERVFC1-1P60608 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms