Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPL2P60520 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPL2P60520 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GABARAPL2P60520 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPL2P60520 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABARAPL2P60520 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL2P60520 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL2P60520 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL2P60520 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL2P60520 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL2P60520 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms