Protein–RNA interactions for Protein: P56937

HSD17B7, 3-keto-steroid reductase, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B7P56937 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSD17B7P56937 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSD17B7P56937 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HSD17B7P56937 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HSD17B7P56937 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HSD17B7P56937 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms