Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN17P56750 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN17P56750 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN17P56750 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN17P56750 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN17P56750 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN17P56750 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms