Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAV3P56539 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAV3P56539 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAV3P56539 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAV3P56539 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAV3P56539 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAV3P56539 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAV3P56539 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAV3P56539 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAV3P56539 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAV3P56539 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAV3P56539 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAV3P56539 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAV3P56539 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAV3P56539 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAV3P56539 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAV3P56539 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAV3P56539 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAV3P56539 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAV3P56539 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAV3P56539 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV3P56539 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAV3P56539 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAV3P56539 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV3P56539 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAV3P56539 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAV3P56539 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAV3P56539 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV3P56539 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV3P56539 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV3P56539 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAV3P56539 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV3P56539 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV3P56539 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAV3P56539 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV3P56539 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV3P56539 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAV3P56539 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAV3P56539 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV3P56539 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV3P56539 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV3P56539 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV3P56539 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAV3P56539 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAV3P56539 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAV3P56539 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAV3P56539 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAV3P56539 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAV3P56539 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAV3P56539 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAV3P56539 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAV3P56539 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAV3P56539 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAV3P56539 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAV3P56539 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAV3P56539 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAV3P56539 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAV3P56539 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAV3P56539 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAV3P56539 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAV3P56539 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAV3P56539 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAV3P56539 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAV3P56539 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAV3P56539 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAV3P56539 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAV3P56539 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAV3P56539 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAV3P56539 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAV3P56539 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAV3P56539 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAV3P56539 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAV3P56539 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAV3P56539 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAV3P56539 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAV3P56539 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAV3P56539 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAV3P56539 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms