Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP1B3P54709 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP1B3P54709 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP1B3P54709 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B3P54709 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B3P54709 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms