Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IST1P53990 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IST1P53990 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IST1P53990 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IST1P53990 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IST1P53990 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IST1P53990 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IST1P53990 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IST1P53990 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IST1P53990 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IST1P53990 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IST1P53990 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IST1P53990 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IST1P53990 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IST1P53990 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IST1P53990 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IST1P53990 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IST1P53990 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IST1P53990 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IST1P53990 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IST1P53990 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IST1P53990 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IST1P53990 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IST1P53990 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IST1P53990 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IST1P53990 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IST1P53990 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IST1P53990 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IST1P53990 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IST1P53990 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IST1P53990 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IST1P53990 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IST1P53990 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IST1P53990 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IST1P53990 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IST1P53990 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IST1P53990 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IST1P53990 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IST1P53990 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IST1P53990 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IST1P53990 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IST1P53990 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IST1P53990 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IST1P53990 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IST1P53990 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IST1P53990 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IST1P53990 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IST1P53990 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IST1P53990 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IST1P53990 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IST1P53990 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IST1P53990 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IST1P53990 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IST1P53990 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IST1P53990 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IST1P53990 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IST1P53990 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IST1P53990 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IST1P53990 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IST1P53990 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IST1P53990 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IST1P53990 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IST1P53990 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IST1P53990 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IST1P53990 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IST1P53990 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IST1P53990 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IST1P53990 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IST1P53990 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IST1P53990 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IST1P53990 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IST1P53990 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IST1P53990 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms