Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RND2P52198 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RND2P52198 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RND2P52198 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RND2P52198 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RND2P52198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RND2P52198 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RND2P52198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RND2P52198 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RND2P52198 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RND2P52198 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RND2P52198 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RND2P52198 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RND2P52198 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RND2P52198 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RND2P52198 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RND2P52198 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RND2P52198 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RND2P52198 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RND2P52198 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RND2P52198 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RND2P52198 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RND2P52198 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RND2P52198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RND2P52198 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RND2P52198 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RND2P52198 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RND2P52198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RND2P52198 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RND2P52198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RND2P52198 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RND2P52198 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RND2P52198 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RND2P52198 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RND2P52198 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RND2P52198 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RND2P52198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RND2P52198 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RND2P52198 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RND2P52198 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RND2P52198 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RND2P52198 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RND2P52198 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RND2P52198 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RND2P52198 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RND2P52198 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RND2P52198 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RND2P52198 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RND2P52198 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RND2P52198 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RND2P52198 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RND2P52198 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RND2P52198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RND2P52198 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RND2P52198 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RND2P52198 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RND2P52198 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RND2P52198 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RND2P52198 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RND2P52198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RND2P52198 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RND2P52198 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RND2P52198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RND2P52198 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RND2P52198 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RND2P52198 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RND2P52198 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RND2P52198 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RND2P52198 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RND2P52198 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RND2P52198 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RND2P52198 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RND2P52198 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RND2P52198 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RND2P52198 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms