Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP16P51512 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP16P51512 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP16P51512 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP16P51512 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP16P51512 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP16P51512 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP16P51512 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP16P51512 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP16P51512 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMP16P51512 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP16P51512 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP16P51512 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP16P51512 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMP16P51512 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP16P51512 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMP16P51512 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP16P51512 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP16P51512 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP16P51512 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP16P51512 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP16P51512 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP16P51512 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP16P51512 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP16P51512 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP16P51512 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP16P51512 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP16P51512 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP16P51512 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP16P51512 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP16P51512 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP16P51512 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP16P51512 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP16P51512 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP16P51512 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP16P51512 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP16P51512 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MMP16P51512 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMP16P51512 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MMP16P51512 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP16P51512 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP16P51512 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP16P51512 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP16P51512 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MMP16P51512 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MMP16P51512 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MMP16P51512 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP16P51512 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP16P51512 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MMP16P51512 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MMP16P51512 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP16P51512 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP16P51512 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP16P51512 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MMP16P51512 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP16P51512 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP16P51512 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP16P51512 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP16P51512 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP16P51512 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP16P51512 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP16P51512 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms