Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCNN1BP51168 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCNN1BP51168 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCNN1BP51168 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCNN1BP51168 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SCNN1BP51168 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCNN1BP51168 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCNN1BP51168 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms