Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPIAP49247 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPIAP49247 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPIAP49247 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPIAP49247 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPIAP49247 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPIAP49247 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPIAP49247 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPIAP49247 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPIAP49247 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPIAP49247 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPIAP49247 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPIAP49247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPIAP49247 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPIAP49247 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPIAP49247 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPIAP49247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPIAP49247 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPIAP49247 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPIAP49247 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPIAP49247 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPIAP49247 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPIAP49247 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPIAP49247 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPIAP49247 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPIAP49247 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPIAP49247 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPIAP49247 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPIAP49247 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPIAP49247 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPIAP49247 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPIAP49247 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RPIAP49247 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPIAP49247 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPIAP49247 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPIAP49247 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPIAP49247 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPIAP49247 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPIAP49247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPIAP49247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPIAP49247 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPIAP49247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPIAP49247 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPIAP49247 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPIAP49247 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPIAP49247 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RPIAP49247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPIAP49247 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPIAP49247 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPIAP49247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPIAP49247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPIAP49247 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPIAP49247 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPIAP49247 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPIAP49247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPIAP49247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPIAP49247 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPIAP49247 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RPIAP49247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPIAP49247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPIAP49247 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPIAP49247 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPIAP49247 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPIAP49247 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPIAP49247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPIAP49247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPIAP49247 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPIAP49247 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPIAP49247 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPIAP49247 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms