Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSNK1DP48730 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSNK1DP48730 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSNK1DP48730 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CSNK1DP48730 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSNK1DP48730 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CSNK1DP48730 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms