Protein–RNA interactions for Protein: P47888

OR3A3, Olfactory receptor 3A3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR3A3P47888 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OR3A3P47888 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OR3A3P47888 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OR3A3P47888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OR3A3P47888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OR3A3P47888 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OR3A3P47888 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms