Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MAGEA4P43358 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MAGEA4P43358 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MAGEA4P43358 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAGEA4P43358 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAGEA4P43358 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms