Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GARSP41250 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GARSP41250 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GARSP41250 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GARSP41250 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GARSP41250 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GARSP41250 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GARSP41250 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GARSP41250 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GARSP41250 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GARSP41250 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GARSP41250 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GARSP41250 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GARSP41250 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
GARSP41250 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GARSP41250 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GARSP41250 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GARSP41250 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GARSP41250 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GARSP41250 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GARSP41250 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GARSP41250 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GARSP41250 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GARSP41250 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GARSP41250 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GARSP41250 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GARSP41250 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GARSP41250 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GARSP41250 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GARSP41250 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GARSP41250 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GARSP41250 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GARSP41250 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GARSP41250 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GARSP41250 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GARSP41250 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GARSP41250 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GARSP41250 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GARSP41250 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GARSP41250 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GARSP41250 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GARSP41250 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GARSP41250 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GARSP41250 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GARSP41250 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GARSP41250 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GARSP41250 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GARSP41250 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GARSP41250 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GARSP41250 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GARSP41250 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GARSP41250 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GARSP41250 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GARSP41250 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GARSP41250 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GARSP41250 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GARSP41250 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GARSP41250 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GARSP41250 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GARSP41250 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GARSP41250 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GARSP41250 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GARSP41250 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GARSP41250 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GARSP41250 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GARSP41250 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GARSP41250 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GARSP41250 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GARSP41250 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GARSP41250 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GARSP41250 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GARSP41250 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GARSP41250 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GARSP41250 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GARSP41250 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GARSP41250 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GARSP41250 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GARSP41250 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GARSP41250 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GARSP41250 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GARSP41250 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GARSP41250 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GARSP41250 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GARSP41250 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GARSP41250 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GARSP41250 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GARSP41250 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GARSP41250 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GARSP41250 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GARSP41250 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GARSP41250 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GARSP41250 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GARSP41250 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GARSP41250 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GARSP41250 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GARSP41250 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GARSP41250 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GARSP41250 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GARSP41250 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GARSP41250 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms