Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNFP41002 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNFP41002 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNFP41002 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNFP41002 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCNFP41002 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNFP41002 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNFP41002 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNFP41002 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNFP41002 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNFP41002 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNFP41002 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNFP41002 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNFP41002 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNFP41002 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNFP41002 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNFP41002 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNFP41002 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNFP41002 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNFP41002 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNFP41002 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNFP41002 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNFP41002 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNFP41002 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNFP41002 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNFP41002 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNFP41002 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNFP41002 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNFP41002 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNFP41002 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNFP41002 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNFP41002 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNFP41002 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNFP41002 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNFP41002 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNFP41002 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNFP41002 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNFP41002 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNFP41002 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNFP41002 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNFP41002 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNFP41002 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNFP41002 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNFP41002 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNFP41002 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNFP41002 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNFP41002 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNFP41002 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNFP41002 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNFP41002 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNFP41002 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNFP41002 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNFP41002 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNFP41002 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNFP41002 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNFP41002 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNFP41002 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNFP41002 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNFP41002 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNFP41002 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNFP41002 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNFP41002 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNFP41002 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNFP41002 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNFP41002 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNFP41002 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNFP41002 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNFP41002 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNFP41002 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNFP41002 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNFP41002 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNFP41002 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNFP41002 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNFP41002 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNFP41002 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNFP41002 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNFP41002 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNFP41002 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNFP41002 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNFP41002 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCNFP41002 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms