Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CEACAM6P40199 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CEACAM6P40199 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM6P40199 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM6P40199 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM6P40199 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM6P40199 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM6P40199 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM6P40199 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM6P40199 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM6P40199 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM6P40199 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM6P40199 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM6P40199 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM6P40199 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM6P40199 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM6P40199 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEACAM6P40199 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM6P40199 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM6P40199 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM6P40199 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM6P40199 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM6P40199 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms