Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP62P37198 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP62P37198 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP62P37198 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP62P37198 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP62P37198 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP62P37198 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP62P37198 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP62P37198 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP62P37198 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP62P37198 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP62P37198 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP62P37198 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP62P37198 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP62P37198 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP62P37198 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP62P37198 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP62P37198 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP62P37198 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP62P37198 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP62P37198 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP62P37198 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP62P37198 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP62P37198 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP62P37198 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP62P37198 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP62P37198 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP62P37198 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP62P37198 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP62P37198 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP62P37198 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP62P37198 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP62P37198 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP62P37198 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP62P37198 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP62P37198 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP62P37198 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP62P37198 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP62P37198 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP62P37198 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP62P37198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP62P37198 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP62P37198 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP62P37198 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP62P37198 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP62P37198 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP62P37198 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP62P37198 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP62P37198 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP62P37198 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP62P37198 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP62P37198 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP62P37198 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP62P37198 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP62P37198 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP62P37198 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP62P37198 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP62P37198 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP62P37198 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP62P37198 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP62P37198 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP62P37198 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP62P37198 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP62P37198 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP62P37198 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP62P37198 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP62P37198 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP62P37198 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP62P37198 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP62P37198 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP62P37198 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP62P37198 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms