Protein–RNA interactions for Protein: P37173

TGFBR2, TGF-beta receptor type-2, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR2P37173 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGFBR2P37173 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGFBR2P37173 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TGFBR2P37173 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGFBR2P37173 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms