Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.062e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.59□□□□□ -0.712e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 210.37□□□□□ -0.752e-18■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 525.45■■□□□ 1.662e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 325.06■■□□□ 1.62e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-208ENST00000529957 922 ntTSL 525.06■■□□□ 1.62e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-206ENST00000527876 550 ntTSL 424.8■■□□□ 1.562e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-207ENST00000529110 552 ntTSL 224.47■■□□□ 1.512e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 GNPTG-202ENST00000526820 572 ntTSL 321.72■■□□□ 1.072e-10■■■■■ 58.6
GTF2F1P35269 ANKRD20A19P-201ENST00000420143 641 ntTSL 326.14■■□□□ 1.782e-10■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-10■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 RNASEH1-202ENST00000436842 2120 ntTSL 224.79■■□□□ 1.562e-14■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 322.79■■□□□ 1.245e-8■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 TNK2-212ENST00000439230 2331 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-14■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 RNASEH1-203ENST00000454734 749 ntTSL 317.89■□□□□ 0.452e-14■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.232e-14■■■■■ 58.5
GTF2F1P35269 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.062e-7■■■■■ 58.3
GTF2F1P35269 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 58.3
GTF2F1P35269 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 516.24■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 58.3
GTF2F1P35269 ACSF3-203ENST00000393145 7020 nt13.78□□□□□ -0.23e-13■■■■■ 58.1
GTF2F1P35269 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 521.78■■□□□ 1.084e-10■■■■■ 57.7
GTF2F1P35269 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.954e-10■■■■■ 57.7
GTF2F1P35269 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.924e-10■■■■■ 57.7
GTF2F1P35269 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 57.7
GTF2F1P35269 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 516.54■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 57.7
GTF2F1P35269 MSI2-213ENST00000581523 534 ntTSL 26.08□□□□□ -1.443e-53■■■■■ 57.5
GTF2F1P35269 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.191e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-211ENST00000568563 1977 ntTSL 521.09■□□□□ 0.971e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-207ENST00000563918 798 ntTSL 219.73■□□□□ 0.751e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-203ENST00000561679 2824 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-212ENST00000570009 680 ntTSL 417.28■□□□□ 0.361e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 KIAA0895L-205ENST00000563831 836 ntTSL 416.5■□□□□ 0.231e-26■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 57.4
GTF2F1P35269 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-16■■■■■ 57.3
GTF2F1P35269 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.536e-16■■■■■ 57.3
GTF2F1P35269 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 57.3
GTF2F1P35269 SNRNP70-207ENST00000598984 547 ntTSL 520.26■□□□□ 0.833e-12■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-208ENST00000450000 574 ntTSL 424.53■■□□□ 1.525e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-209ENST00000463244 545 ntTSL 423.8■■□□□ 1.45e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-204ENST00000413232 727 ntTSL 321.81■■□□□ 1.085e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 419.17■□□□□ 0.665e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.475e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.285e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.185e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 514.59□□□□□ -0.075e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 513.4□□□□□ -0.265e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 311.74□□□□□ -0.535e-10■■■■■ 57.2
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GTF2F1P35269 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 39.21□□□□□ -0.945e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 28.29□□□□□ -1.085e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.265e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 56.88□□□□□ -1.315e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 CPSF7-210ENST00000474684 635 ntTSL 36.71□□□□□ -1.345e-10■■■■■ 57.2
GTF2F1P35269 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.478e-10■■■■■ 57
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GTF2F1P35269 USP54-206ENST00000433394 600 ntTSL 59.09□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 57
GTF2F1P35269 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.356e-9■■■■■ 57
GTF2F1P35269 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.396e-9■■■■■ 57
GTF2F1P35269 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.16e-9■■■■■ 57
GTF2F1P35269 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.176e-9■■■■■ 57
GTF2F1P35269 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 514.6□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 56.9
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GTF2F1P35269 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.145e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.095e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.015e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.975e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.965e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PTPA-208ENST00000411917 738 ntTSL 321.04■□□□□ 0.965e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.775e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.695e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.615e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.585e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.525e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.435e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 517.05■□□□□ 0.325e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-225ENST00000561453 3719 ntTSL 516.53■□□□□ 0.245e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.175e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 515.91■□□□□ 0.145e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.075e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.065e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.055e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.015e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.175e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.175e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 TLE3-224ENST00000560996 495 ntTSL 512.34□□□□□ -0.435e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 MCM7-208ENST00000467516 776 ntTSL 212.25□□□□□ -0.455e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 MCM7-207ENST00000465738 448 ntTSL 210.51□□□□□ -0.735e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PTPA-212ENST00000417728 967 ntTSL 310.45□□□□□ -0.745e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 PAX8-AS1-209ENST00000510859 2313 ntTSL 29.72□□□□□ -0.855e-14■■■■■ 56.8
GTF2F1P35269 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.917e-7■■■■■ 56.8
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