Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA6P31267 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOXA6P31267 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA6P31267 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA6P31267 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA6P31267 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms