Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB2P29323 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB2P29323 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB2P29323 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EPHB2P29323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPHB2P29323 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPHB2P29323 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms