Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTR1BP28222 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HTR1BP28222 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HTR1BP28222 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTR1BP28222 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms