Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALRP27797 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALRP27797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CALRP27797 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALRP27797 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALRP27797 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALRP27797 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALRP27797 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALRP27797 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALRP27797 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALRP27797 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALRP27797 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALRP27797 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALRP27797 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALRP27797 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALRP27797 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALRP27797 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALRP27797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALRP27797 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALRP27797 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALRP27797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALRP27797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALRP27797 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALRP27797 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALRP27797 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALRP27797 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALRP27797 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALRP27797 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALRP27797 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALRP27797 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CALRP27797 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALRP27797 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALRP27797 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CALRP27797 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALRP27797 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALRP27797 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALRP27797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALRP27797 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CALRP27797 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALRP27797 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALRP27797 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CALRP27797 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALRP27797 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALRP27797 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CALRP27797 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CALRP27797 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALRP27797 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CALRP27797 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALRP27797 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CALRP27797 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALRP27797 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALRP27797 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALRP27797 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALRP27797 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALRP27797 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CALRP27797 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CALRP27797 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALRP27797 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALRP27797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALRP27797 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CALRP27797 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALRP27797 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALRP27797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALRP27797 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CALRP27797 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALRP27797 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALRP27797 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CALRP27797 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CALRP27797 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALRP27797 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALRP27797 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALRP27797 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALRP27797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALRP27797 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALRP27797 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALRP27797 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALRP27797 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALRP27797 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALRP27797 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALRP27797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALRP27797 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALRP27797 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALRP27797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALRP27797 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALRP27797 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALRP27797 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALRP27797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALRP27797 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALRP27797 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALRP27797 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALRP27797 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALRP27797 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALRP27797 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALRP27797 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALRP27797 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALRP27797 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALRP27797 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALRP27797 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALRP27797 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALRP27797 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms