Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APEX1P27695 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX1P27695 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX1P27695 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX1P27695 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX1P27695 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APEX1P27695 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX1P27695 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX1P27695 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX1P27695 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APEX1P27695 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX1P27695 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX1P27695 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX1P27695 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APEX1P27695 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX1P27695 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX1P27695 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APEX1P27695 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX1P27695 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX1P27695 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX1P27695 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX1P27695 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APEX1P27695 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX1P27695 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX1P27695 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX1P27695 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX1P27695 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX1P27695 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APEX1P27695 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX1P27695 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX1P27695 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX1P27695 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX1P27695 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APEX1P27695 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX1P27695 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX1P27695 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX1P27695 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX1P27695 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APEX1P27695 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APEX1P27695 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX1P27695 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APEX1P27695 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APEX1P27695 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX1P27695 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX1P27695 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APEX1P27695 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APEX1P27695 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX1P27695 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX1P27695 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX1P27695 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX1P27695 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX1P27695 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APEX1P27695 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX1P27695 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX1P27695 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APEX1P27695 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX1P27695 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX1P27695 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APEX1P27695 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APEX1P27695 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX1P27695 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APEX1P27695 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APEX1P27695 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APEX1P27695 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX1P27695 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX1P27695 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APEX1P27695 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APEX1P27695 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
APEX1P27695 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms