Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2P24941 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK2P24941 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2P24941 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2P24941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2P24941 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2P24941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2P24941 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK2P24941 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK2P24941 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK2P24941 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK2P24941 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2P24941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2P24941 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK2P24941 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2P24941 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK2P24941 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2P24941 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK2P24941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2P24941 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2P24941 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2P24941 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2P24941 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK2P24941 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2P24941 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK2P24941 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2P24941 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK2P24941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK2P24941 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK2P24941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2P24941 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2P24941 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2P24941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK2P24941 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK2P24941 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2P24941 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2P24941 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2P24941 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2P24941 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK2P24941 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2P24941 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2P24941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2P24941 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK2P24941 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2P24941 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK2P24941 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK2P24941 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK2P24941 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2P24941 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2P24941 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2P24941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK2P24941 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK2P24941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2P24941 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK2P24941 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2P24941 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2P24941 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2P24941 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK2P24941 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK2P24941 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2P24941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK2P24941 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK2P24941 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK2P24941 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK2P24941 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK2P24941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK2P24941 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDK2P24941 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms