Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRR1P24046 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRR1P24046 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRR1P24046 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRR1P24046 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRR1P24046 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms