Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F8A1P23610 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F8A1P23610 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F8A1P23610 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8A1P23610 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8A1P23610 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8A1P23610 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8A1P23610 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8A1P23610 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8A1P23610 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8A1P23610 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8A1P23610 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8A1P23610 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8A1P23610 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8A1P23610 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8A1P23610 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8A1P23610 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8A1P23610 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8A1P23610 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8A1P23610 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8A1P23610 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8A1P23610 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8A1P23610 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8A1P23610 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8A1P23610 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8A1P23610 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8A1P23610 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8A1P23610 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
F8A1P23610 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
F8A1P23610 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8A1P23610 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8A1P23610 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8A1P23610 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8A1P23610 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8A1P23610 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8A1P23610 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
F8A1P23610 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8A1P23610 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8A1P23610 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F8A1P23610 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8A1P23610 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8A1P23610 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
F8A1P23610 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F8A1P23610 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8A1P23610 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8A1P23610 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F8A1P23610 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8A1P23610 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F8A1P23610 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
F8A1P23610 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8A1P23610 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8A1P23610 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8A1P23610 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
F8A1P23610 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8A1P23610 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8A1P23610 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8A1P23610 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8A1P23610 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8A1P23610 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
F8A1P23610 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F8A1P23610 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
F8A1P23610 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8A1P23610 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F8A1P23610 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8A1P23610 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
F8A1P23610 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8A1P23610 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F8A1P23610 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8A1P23610 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8A1P23610 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8A1P23610 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8A1P23610 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F8A1P23610 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8A1P23610 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F8A1P23610 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F8A1P23610 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8A1P23610 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8A1P23610 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8A1P23610 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8A1P23610 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8A1P23610 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F8A1P23610 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms