Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPRR1BP22528 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPRR1BP22528 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPRR1BP22528 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPRR1BP22528 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms