Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCP2P22307 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCP2P22307 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCP2P22307 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCP2P22307 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCP2P22307 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCP2P22307 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCP2P22307 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCP2P22307 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCP2P22307 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCP2P22307 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCP2P22307 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCP2P22307 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCP2P22307 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCP2P22307 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCP2P22307 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCP2P22307 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCP2P22307 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCP2P22307 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCP2P22307 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCP2P22307 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCP2P22307 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCP2P22307 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCP2P22307 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCP2P22307 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCP2P22307 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCP2P22307 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCP2P22307 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCP2P22307 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCP2P22307 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCP2P22307 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCP2P22307 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCP2P22307 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCP2P22307 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCP2P22307 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SCP2P22307 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCP2P22307 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCP2P22307 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCP2P22307 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCP2P22307 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCP2P22307 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCP2P22307 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCP2P22307 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCP2P22307 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCP2P22307 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCP2P22307 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCP2P22307 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCP2P22307 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCP2P22307 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCP2P22307 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCP2P22307 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCP2P22307 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCP2P22307 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCP2P22307 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCP2P22307 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCP2P22307 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SCP2P22307 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCP2P22307 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCP2P22307 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCP2P22307 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCP2P22307 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCP2P22307 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCP2P22307 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCP2P22307 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCP2P22307 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCP2P22307 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCP2P22307 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCP2P22307 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCP2P22307 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCP2P22307 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCP2P22307 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCP2P22307 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCP2P22307 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCP2P22307 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCP2P22307 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCP2P22307 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCP2P22307 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCP2P22307 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCP2P22307 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCP2P22307 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCP2P22307 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCP2P22307 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCP2P22307 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCP2P22307 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCP2P22307 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCP2P22307 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCP2P22307 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCP2P22307 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCP2P22307 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCP2P22307 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCP2P22307 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCP2P22307 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SCP2P22307 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCP2P22307 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms